Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD4Q9NXE4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD4Q9NXE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms