Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM6Q9NX76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMTM6Q9NX76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms