Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms