Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMC4Q9NTJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms