Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCDHB16Q9NRJ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHB16Q9NRJ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms