Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2B1Q9NRF2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms