Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO8Q9NRD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms