Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms