Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSS2Q9NR19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms