Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms