Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms