Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms