Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD248Q9HCU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms