Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM8AQ9HCN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms