Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA4Q9HCM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms