Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX8Q9HC52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms