Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LY9Q9HBG7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms