Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms