Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF2Q9HAK2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms