Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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