Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms