Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms