Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF3Q9H4D5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms