Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms