Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-4Q9H2Z4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-4Q9H2Z4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms