Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB1BQ9H0U4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB1BQ9H0U4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms