Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ9H0N0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms