Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms