Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms