Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP44Q9C0F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms