Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GSDMCQ9BYG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms