Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCGF6Q9BYE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCGF6Q9BYE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms