Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms