Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms