Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALN1Q9BXU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALN1Q9BXU9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239 ms