Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms