Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms