Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD2Q9BSE4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms