Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHDC3Q9BQ90 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms