Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VGLL1Q99990 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms