Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms