Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDNQ99608 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDNQ99608 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDNQ99608 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDNQ99608 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDNQ99608 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms