Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNF2Q99496 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF2Q99496 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms