Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTCH4Q99466 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms