Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms