Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

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Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMCN1Q96RW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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