Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms