Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGLYRP2Q96PD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms