Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms