Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms